El INER realiza hace más de 15 años la Vigilancia de la Enfermedad tipo influenza (ETI) o Gripe mediante la estrategia de Unidad Centinela, con el objetivo principal de monitorear la actividad de influenza en la comunidad, para contribuir a la implementación de estrategias de prevención y control de la enfermedad a nivel local y nacional. Esta misma estrategia, se utiliza para la vigilancia de COVID-19.
El Servicio de Virus Respiratorios del Departamento Diagnóstico y Referencia ha incorporado el diagnóstico de COVID-19 mediante la técnica RT-PCR real time. Paralelamente desde el inicio de la pandemia viene trabajando junto a autoridades provinciales y nacionales en la adaptación de los protocolos de Investigación y Vigilancia en este nuevo contexto para fortalecer la respuesta sanitaria en la región.