El Departamento Micología, Laboratorio Referente Nacional de Micología, asiste a la Red Nacional de Laboratorios y centros de salud centralizando la ejecución de técnicas diagnósticas que por su complejidad o razones operativas no pueden ser realizadas por los laboratorios hospitalarios, difundiendo el conocimiento, capacitando personal crítico, produciendo y proveyendo reactivos para serodiagnóstico de micosis sistémicas y cepas fúngicas para docencia, investigación y control de calidad, estandarizando y/o desarrollando métodos diagnósticos, llevando a cabo investigaciones y estudios multicéntricos en patologías de relevancia nacional en el marco de los Programas Nacionales de Salud con los laboratorios de la Red Nacional de Micología y del Programa Nacional de Control de Calidad en Micología.
Entre otras actividades de importancia lleva a cabo la Supervisión de la calidad de técnicas y procedimientos a través del Programa Nacional de Control de Calidad en Micología, coordina la Red Nacional de Laboratorios de Micología a nivel nacional, colabora activamente en el desarrollo de las redes provinciales de laboratorio, y asesora y participa con el Sistema Nacional de vigilancia epidemiológica desde el laboratorio (SIVILA) aportando datos e información en su función de Laboratorio Nacional de Referencia en Micología.
