Pseudomonas

Se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥ 2,00 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE < 1,70 = no identifica

 

Dada la complejidad del género por las numerosas especies que contiene, existen consideraciones particulares:

  • Las especies P. oryzihabitans, P. aeruginosa, P. stutzeri, P. chlororaphi, P. indica pueden ser bien identificadas a nivel de especie.
  • P. salomonii no está en BD. MALDI-TOF da P. antarctica/extremorientalis.
  • Pseudomonas cichorii/syringae: secuenciar.
  • Pseudomonas azotoformans no es identificada. Se sugiere secuenciar.
  • P. alcaliphila/oleovorans/pseudoalcaligenes: MALDI-TOF no lograr discriminar estas especies, se recomienda gyrB.

 

En las siguientes especies informar a nivel de grupo/complejo:

  • P. plecoglossicida, P. monteilii, P. mossellii, P. putida, P. fulva: se informan como Pseudomonas grupo putida.
  • P. lundensis, P. vietnamiensis, P. fluorescens, P. libanensis, P. koorensis: se informan como Pseudomonas grupo fluorescens.

En estas especies no se puede alcanzar la diferenciación por pruebas fenotípicas ni por secuenciación de gen 16S ARNr. Se recomienda gyrB y rpoD para confirmar.

 

Tabla 99. Traducción de especies de Pseudomonas spp.

Especie Presencia en BD Nro de MSPs en BD Nomenclatura

actual

P Download Windows 7 Hangul Pack. aeruginosa SI 9  
P. aestusnigri NO    
P. agarici SI 1  
P. alcaligenes SI 2  
P. alcaliphila SI 1  
P. amygdali NO    
P. anguilliseptica SI 1  
P. antartica SI 1  
P. argentinensis NO    
P. asplenii SI 1  
P. asturiensis NO    
P. asuensis NO    
P. avellanae SI 1  
P. azotifigens SI 1  
P. azotoformans SI 1  
P. baetica NO    
P. balearica SI 2  
P. bauzanensis NO    
P Download virtual machines. benzenivorans NO    
P. beteli NO    
P. borbori NO    
P. boreopolis SI 1  
P. brassicasearum NO    
P. brenneri SI 1  
P. caeni NO    
P. canadensis NO    
P. cannabina NO    
P. carboxydohydrogena NO    
P. caricapapayae SI 1  
P. caspiana NO    
P. cedrina SI 1  
P. cerasi NO    
P. chengduensis NO    
P. chlororaphis SI 2  
P. cichori SI 1  
P. cissicola NO    
P Outlook 2010 free. citronellosis SI 2  
P. composti NO    
P. congelans SI 1  
P. corrugata SI 1  
P. costantini NO    
P. cremoricolorata NO    
P. cuatrocienegasensis NO    
P. delhiensis NO    
P. donhuensis NO    
P. duriflava NO    
P. endophytica NO    
P. entomophila NO    
P. extremaustralis NO    
P. extremorientalis SI 1  
P. flavescens SI 1  
P. flexibilis NO    
P. floridensis NO    
P. fluorescens SI 6  
P 1 cm of ego. fluvialis NO    
P. formosensis NO    
P. fragi SI 1  
P. frederiksbergensis SI 1  
P. fulva SI 2  
P. furukawai NO    
P. fuscovaginae SI 1  
P. gelidicola NO    
P. geniculata NO    
P. gessardii SI 1  
P. glareae NO    
P. graminis SI 1  
P. granadensis NO    
P. grimontii SI 1  
P. guineae NO    
P. halophila NO    
P. helleri NO    
P. helmanticenis NO    
P 7 books in one piece. hibiscicola NO    
P. hussaini NO    
P. indica SI 1  
P. japonica NO    
P. jessenii SI 1  
P. jinjuensis SI 1  
P. kilonensis SI 1  
P. koreensis SI 3  
P. kunmingensis NO    
P. lactis NO    
P. libanensis SI 1  
P. lini NO    
P. linyingensis NO    
P. litoralis NO    
P. lundensis SI 1  
P. lutea SI 1  
P. luteola SI 3 Chryseomonas luteola
P. mandelii SI 1  
P Download snagit. marginalis SI 1  
P. maricola NO    
P. mediterranea NO    
P. meliae NO    
P. mendocina SI 1  
P. meridiana NO    
P. miguale SI 1  
P. monteillii SI 7  
P. moorei NO    
P. moraviensis NO    
P. mosselii SI 1  
P. mucidolens SI 1  
P. nitritireducens NO    
P. nitroreducens SI 2  
P. oleovorans SI 3  
P. orientalis SI 1  
P. oryzihabitans SI 7 Flavimonas oryzihabitans
P Download php 5 6. otitidis SI 1  
P. pachastrellae NO    
P. palleroniana NO    
P. panacis NO    
P. panipatensis SI 1  
P. parafulva NO    
P. paralactis NO    
P. pelagia NO    
P. peli NO    
P. pertucinogena SI 1  
P. pictorum SI 1 Stenotrophomonas pictorum
P. plecoglosicida SI 6  
P. poae SI 1  
P. phoangensis SI 1  
P. populi NO    
P. profundi NO    
P. prosekii NO    
P Download the nanolist. proteolytica SI 1  
P. pseudoalcaligenes SI 1 Pseudomonas oleovorans
P. psycrophila SI 1  
P. psycrotolerans NO    
P. punonensis NO    
P. putida SI 26  
P. reinekei NO    
P. resinovorans NO    
P. rhodesiae SI 1  
P. rhizosphaerae SI 1  
P. sabulinigri NO    
P. sagittaria NO    
P. salina NO    
P. salomonii NO    
P. saponiphila NO    
P. savastanoi SI 2  
P. segetis SI 1  
P. sesami NO    
P Windows Ten. simiae NO    
P. soli NO    
Pseudomonas sp. SI 8  
P. straminea SI 1  
P. stutzeri SI 10  
P. synxantha SI 1  
P. syringae SI 2  
P. taeaenensis NO    
P. taetrolens SI 1  
P. taiwanensis NO    
P. tarimensis SI 1  
P. testosteronii NO    
P. thermotolerans SI 1  
P. thivervalensis SI 1  
P. tolaasii SI 1  
P. toyotomiensis NO    
P. tremae NO    
P. trivialis SI 1  
P 안드로이드 추가. tuomuorensis NO    
P. umsongensis SI 1  
P. vancouverensis SI 1  
P. veronii SI 4  
P. versuta NO    
P. viridiflava SI 1  
P. vranovensis NO    
P. wadenswilerensis NO    
P. xanthomarina SI 1  
P. xiamenensis NO    
P. zeshuii NO    
P. zahodongensis NO    

 

Referencias:

  • Almuzara M, Barberis C, Traglia G, Famiglietti A, Ramirez MS, Vay C. Evaluation of matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry for species identification of nonfermenting Gram-negative bacilli. J Microbiol Methods 2015;112:24-7. doi: 10.1016/j.mimet.2015.03.004.