Staphylococcus

Se sugiere utilizar un método de extracción directa (con 1 μl de ácido fórmico al 70 %) y considerar los siguientes valores de corte:

SCORE ≥1,7= identificación correcta a nivel de especie
SCORE 1,5-1,7= identificación correcta a nivel de género
SCORE <1,5= identificación no confiable

Tabla 114. Especies de Staphylococcus spp. incluidas en la Base de Datos Biotyper software 3.1 (Bruker Daltonics)

ID por MALDI TOF	Presencia en BD	Nro de MSPs en BD	INFORMAR	Observaciones	Referencias
S. chromogenes	SI	1	SI	Aislado de animales de pezuñas hendidas o partidas (artiodáctilos): ovejas, cabras, venados, camellos, ganado vacuno y cerdos). Produce mastitis bovina.
S. arlettae	SI	3	SI (habitualmente se obtiene ID no confiable, independientemente del score usado)	Especie de ECN Novobiocina R aislada de animales	Han et al. 2015; Ayeni et al. 2017
S. aureus	SI	14	SI
S. auricularis	SI	6	SI	Identificación solo a nivel de género	Han et al. 2015
S. capitis ssp capitis	SI	6	SI	Discrimina a nivel de subespecie	Zhu et al. 2015
S. capitis ssp ureolyticus	SI	1	SI	Discrimina a nivel de subespecie	Zhu et al. 2015
S. caprae	SI	8	SI	Especie aislada de leche de cabra. Patógeno emergente en infecciones humanas (osteoarticulares, endocarditis, etc)	Seng et al. 2014; Kwok et al Download Maliflower mp3. 2016
S. carnosus ssp carnosus	SI	1	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los distintos trabajos no especifican si discrimina a nivel de subespecie
S. carnosus ssp utilis	SI	2	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los distintos trabajos no especifican si discrimina a nivel de subespecie
S. cohnii ssp cohnii	SI	4	SI	Discrimina a nivel de subespecie. Especie de ECN Novobiocina R	Zhu et al. 2015
S. cohnii ssp urealyticus	SI	2	SI	Discrimina a nivel de subespecie. Especie de ECN Novobiocina R	Zhu et al. 2015
S. condimenti	SI	2	SI	Aislado de muestras de alimentos (salsa de soja). También aislado de infecciones humanas (bacteriemia asociada a catéter)	Misawa at al. 2014
S. delphini	SI	19	SI	Especie coagulasa positiva, aislada de delfines y de caballos. Forma parte del grupo S. intermedius (SIG) junto con S. intermedius y S. pseudointermedius	Han et al. 2015; Silva et al. 2015; Decristophoris et al. 2011
S. epidermidis	SI	10	SI
S. equorum	SI	4	SI	Especie de ECN Novobiocina R aislada de animales
S Download Fossil Fighter. felis	SI	8	SI	Especie aislada de muestras clínicas de gatos
S. fleurettii	SI	1	Da scores bajos	Usando >2 (para especie) solo discrimina a nivel de género. Usando >1,7 (para especie) ID incorrecta como S. sciuri. Especie Novobiocina Resistente	Han et al. 2015
S. gallinarum	SI	5	ND	Especie de ECN Novobiocina R aislado de animales
S. haemolyticus	SI	12	SI
S. hominis ssp hominis	SI	6	SI	Discrimina a nivel de subespecie	Zhu et al. 2015
S. hominis ssp novobiosepticus	SI	1	SI	Discrimina a nivel de subespecie. Novobiocina R	Zhu 2015
S. hyicus	SI	2	SI	Especie coagulasa variable aislada de cerdos
S. intermedius	SI	12	SI	ID correcta a nivel de especie, independientemente el score usado. Especie coagulasa positiva, aislada de palomas. Forma parte del grupo S. intermedius (SIG) junto con S. delphini y S. pseudointermedius	Han et al Download the gba emulation. 2015; Silva et al. 2015; Decristophoris et al. 2011
S. kloosii	SI	4	SI	Especie de ECN Novobiocina R aislada de animales
S. lentus	SI	9	SI	Ex Staphylococcus sciuri ssp lentus. Especie de ECN Novobiocina R
S. lugdunensis	SI	7	SI
S. lutrae	SI	6	SI	Especie coagulasa positiva aislada de nutrias
S. microti	SI	4	ND	Especie aislada de Microtus arvalis (una especie de roedor de la familia Cricetidae ampliamente distribuido por Europa y algunas zonas de Asia). Especie Novobiocina R
S. muscae	SI	1	SI	Especie aislada de moscas
S. nepalensis	SI	5	SI	Especie aislada de cabras del Himalaya. Novobiocina R
S. pasteuri	SI	8	SI	Especie aislada de muestras humanas, animales y alimentos. Su nombre es en honor al microbiólogo francés Louis Pasteur por su contribución en 1878 al reconocimiento de estafilococos como agentes patógenos y también al instituto de investigación Instituto Pasteur, París, Francia, donde se caracterizó la nueva especie
S. pettenkoferi	SI	6	SI	Especie de ECN aislada de muestras humanas	Trulzsch et al. 2002
S. piscifermentans	SI	2	SI	Especie de ECN aislada de pescado fermentado en Tailandia	Tanasupawat et al. 1992
S. pseudointermedius	SI	5	NO (Solo informar como grupo Staphylococcus intermedius): SIG	ID incorrecta como S. intermedius independientemente del score usado. Especie coagulasa positiva, aislada de perros y gatos domésticos. Forma parte del grupo S. intermedius (SIG) junto con S. intermedius y S. delphini	Han et al. 2015; Silva et al. 2015; Murugaiyan et al. 2014; Devriese et al. 2005
S. saccharolyticus	SI	5	SI	Especie anaerobia de Staphylococcus. Anteriormente clasificado como Peptococcus saccharolyticus	Young et al. 2017
S. saprophyticus ssp bovis	SI	1	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subsp. Esta subsp es de aislamiento animal (fosas nasales bovinas). Novobiocina R
S. saprophyticus ssp saprophyticus	SI	9	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subespecie. Novobiocina R
S. schleiferi ssp coagulans	SI	3	SI	Especie coagulasa positiva
S. schleiferi ssp schleiferi	SI	4	SI
S. sciuri ssp carnaticus	SI	2	SI (por lo menos a nivel de especie)	Novobiocina R. Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subsp.
S. sciuri ssp rodentium	SI	2	SI (por lo menos a nivel de especie)	Novobiocina R. Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subsp
S. sciuri ssp sciuri	SI	4	SI	Novobiocina R.
S. simiae	SI	4	SI	Especie aislada de monos ardilla de América del Sur
S. simulans	SI	9	SI	Denominado como tal por su similitud con ciertas especies de estafilococos coagulasa positiva (incluyendo S. aureus)
S. succinus ssp casei	SI	1	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subsp. Especie aislada de la superficie del queso madurado. Novobiocina R.
S. succinus ssp succinus	SI	1	SI (por lo menos a nivel de especie)	Los trabajos no especifican si discrimina a nivel de subsp. Especie Novobiocina R, aislada de ámbar dominicano.
S. vitulinus	SI	6	SI	Nombre actual de S. pulvereri. Novobiocina R.	Švec et al. 2004
S. warneri	SI	7	SI	Su nombre es en honor a Arthur Warner, quien originalmente aisló este microorganismo.
S. xylosus	SI	7	SI	Novobiocina R

Especies de Staphylococcus spp. NO incluidas en la Base de Datos de Bruker:

1) De aislamiento animal o del ambiente:

Staphylococcus agnetis (Taponen et al. 2012, sp. nov.). Especie coagulasa variable aislada de leche bovina.

Staphylococcus argensis (Heβ and Gallert 2015, sp. nov.)

Staphylococcus caseolyticus (ex Evans 1916) Schleifer et al. 1982, nom. rev., comb. nov. (Actualmente: Macrococcus caseolyticus (Schleifer et al. 1982) Kloos et al. 1998, comb. nov.)

Staphylococcus edaphicus (Pantůček et al. 2018, sp. nov.)

Staphylococcus rostri (Riesen and Perreten 2010, sp. nov.). Aislado de las narinas de cerdos sanos (Riesen et al., 2010).

Staphylococcus schweitzeri (Tong et al. 2015, sp. nov.). Forma parte del complejo Staphylococcus aureus pero se lo ha aislado de primates NO humanos (Tong et al., 2015)

Staphylococcus stepanovicii (Hauschild et al. 2012, sp. nov.). Especie Novobiocina R y Oxidasa positiva aislada de ciertos pequeños mamíferos salvajes (Hauschild et al., 2010).

2) De aislamiento humano:

Staphylococcus argenteus (Tong et al. 2015, sp. nov.) Es una especie del complejo Staphylococcus aureus, patógeno emergente en infecciones osteoarticulares, identificado por MALDI-TOF con valores de score de 1,39 a 1,87 como S. aureus, S. simiae o S. epidermidis (Rigaill et al., 2017)

Staphylococcus jettensis (De Bel et al. 2013, sp. nov.).

Staphylococcus massiliensis (Al Masalma et al. 2010, sp. nov.) Aislado de absceso de cerebro (Al Masalma et al., 2010).

Staphylococcus petrasii (Pantůček et al. 2013, sp. nov.) Aislado de infecciones óticas (Pantucek et al., 2013).

Referencias:

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