Se han aceptado valores de score para una identificación confiable:
SCORE >1,7 = identificación a nivel de especie
SCORE 1,5-1,69 = identificación a nivel de género
SCORE <1,5 = no identifica
Las especies lipofílicas pueden arrojar scores más bajos. El agregado de 1μl de ácido fórmico puede mejorar la identificación (valores de score).
Suele no identificar C. pyruviciproducens a pesar de existir un MSP de referencia en la BD comercial para esta especie.
MALDI-TOF identifica correctamente C. mucifaciens, C. kroppenstedtii y C. tuberculostearicum.
La metodología recomendada para la completa identificación de la mayoría de las especies corineiformes es la secuenciación del gen rpoB.
Importante: C. diphtheriae, C. ulcerans y C. pseudotuberculosis deben ser derivados al Servicio de Bacteriología Clínica del INEI-ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán” para la búsqueda de toxinas mediante PCR.
Tabla 39. Limitaciones en la identificación para especies de Corynebacterium spp 4영리 다운로드.
ID por MALDI-TOF | Posibles errores en la ID | Confirmación | Informar |
C. aurimucosum |
No discrimina
C. aurimucosum / C. minutissimum |
Fenotipia: DNAsa, Hipurato, Tirosina
Secuenciación rpoB |
Si colonia cremosa, DNAsa -, Hipu +, Tirosina -: C. aurimucosum (confirmar con secuenciación) |
C. minutissimum |
No discrimina
C aurimucosum / C.minutissimum/ C. singulare / C amycolatum |
Fenotipia: DNAsa, Hipurato, Tirosina
Secuenciación rpoB |
Si colonia pequeña seca, DNAsa +tardía, Hip-, Tirosina +: C. minutissimum (confirmar con secueciacion) |
C. pseudodiphteriticum
|
No discrimina
C 레고 마인드스톰 다운로드. pseudodiphteriticum / C. propinquum |
Urea +
Secuenciación rpoB |
Si urea +, no se puede diferenciar con C. propinquum: informar según rpoB |
C. propinquum |
No discrimina
C. pseudodiphteriticum / C. propinquum |
Urea -/+
Secuenciación rpoB |
Si urea –, informar como C. propinquum |
C. striatum | Puede confundir con
C. simulans |
CAMP, Etilenglicol
Secuenciación rpoB |
Si CAMP+, informar C. striatum. Si CAMP-, etilenglicol +: informar C. striatum |
C. simulans | Puede confundir con
C Download the gba game. striatum |
CAMP, Etilenglicol
Secuenciación rpoB |
Si CAMP-, Etilenglicol –: informar C. simulans |
C.coyleae | Puede confundir con
C. afermentans |
LAP
Secuenciación rpoB |
LAP+: informar como C. coyleae |
C. amycolatum | Puede confundir con
C. aurimucosum o C. minutissimum |
Fenotipia: aspecto colonia, NO3, urea, tributirina
Secuenciacion rpoB |
Si colonica seca, cerosa NO3+, urea +, tributirina +: informar como C. amycolatum. Si dichas pruebas son – completar fenotipia y secuenciación. |
Las siguientes especies no se encuentran representadas en la base de datos comercial:
- C 홈앤쇼핑. aquatimens
- C. atypicum
- C. lowii
- C. masiliense
- C. oculi
- C. pilbarense
- C. sputi
- C. timonense
Especies generalmente multiresistentes:
- C. afermentans ss afermentans
- C. amycolatum
- C. aurimucosum
- C. confusum
- C. coyleae
- C. glucuronolyticum
- C. jeikeium
- C. macginleyi
- C. minutissimum
- C. propinquum
- C. pseudodiphtheriticum
- C. resistens
- C. striatum
- C. tuberculostearicum
- C Download the swing browser file. urealyticum
- C. ureicelerivorans
Tabla 40. Marcadores fenotípicos para diferenciación de especies con alta similitud en el gen 16S ARNr.
Especies con alta similitud 16S ARNr | Marcadores fenotípicos | Confirmación |
C. afermentans
C. coyleae C. mucifaciens |
C. afermentans sb afermentans: metabolismo fermentativo, CAMP V
C. coyleae: metabolismo oxidativo, CAMP + C. mucifaciens: colonias mucoides amarillas
|
rpoB |
C. aurimucosum
C. minutissimum C. singulare |
C. aurimucosum: colonias amarillas, algunas socaban agar, algunas pigmento gris-negro
C bm98 다운로드. minutissimum: tirosina +, Urea – C. singulare: tirosina +, Urea + |
rpoB |
C. propinquum
C.pseudodiphtheriticum |
C. pseudodiphteriticum: Urea –
C. propinquum: Urea + |
rpoB |
C. sundsvallense
C. thomssenii |
Fenotípicamente indistinguibles | rpoB |
C. ulcerans
C. pseudotuberculosis |
Ambos CAMP reverso +
C. ulcerans: O129 sensible C. pseudotuberculosis: O129 resistente Pueden tener toxina diphtherica + |
rpoB |
C 안드로이드 터치. xerosis
C. hansenii C. freneyi |
C. xerosis: PAL +, α-glu V, desarrollo 20ºC -, Ferm Glu 42C –
C. hansenii: PAL – C. freneyi: PAL +, α-glu +, Desarrollo 20ºC +, Ferm Glu 42C + |
rpoB parcial no discrimina |
C. ureicelerivorans
C. mucifaciens
|
C. ureicelerivorans: urea Rápida, colonia lisa
C. mucifaciens: urea -, colonia mucoide amarilla |
rpoB parcial no discrimina |
Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales.
Referencias:
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