Acinetobacter

Las limitaciones de MALDI-TOF ocurren en la identificación de las especies del complejo A. calcoaceticus/A. baumannii, A. junii/A. johnsonii y A. guillouiae,  y para aquellas especies que están pobremente representadas o no están incluidas en la base de datos de espectros proteicos, como  A. soli, A. beijerinckii, A. berenziniae, A. variabilis.

Para una completa identificación a nivel de especie se requiere la secuenciación de genes tales como rpoB, gyrB y recA.

 

Los resultados serán informados siguiendo las recomendaciones del fabricante y considerando el criterio del 10% de divergencia entre la primera especie y la distinta siguiente del Top Ten.

SCORE ≥2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

 

Tabla 3 맥 에버노트 다운로드. Traducción para especies de Acinetobacter spp.

ID por MALDI-TOF Presencia en BD Nro de MSPs  en BD Informar

solo con score ≥ 2

 Observaciones
A. pitti SI 18 A. pitti  
A. nosocomialis SI 8 Acinetobacter sp. A. baumannii puede ser identificado como A. nosocomialis.

Informar complejo A. baumanii/nosocomialis

Confirmar especie mediante rpoB.
A. baumannii

 

 SI 12 A. baumannii A 블리자드 디아블로2 확장팩 다운로드. baumannii puede ser identificado como A. nosocomialis.

Informar complejo A. baumanii/nosocomialis
 

A. calcoaceticus

 SI 10 Complejo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii  
A. guillouiae SI 2 Acinetobacter sp. Confirmar especie con rpoB.

Picos caracteristicos de

A. guillouiae: 3258, 3690,  6513, 6978,  7378,  7813Da.
A. junii SI 8 A. junii/A johnsonii  
A 오토캐드 2018 한글. radioresistens SI 8 A. radioresistens  
A. baylyi SI 3 Acinetobacter sp. Diferenciar de A. bereziniae y  de A.soli.

Confirmar especie con rpoB
A. ursingii SI 9 A. ursingii  
A. lwoffii SI 11 A. lwoffii  
A. bereziniae SI 1 Acinetobacter sp gpg4win 다운로드. Confirmar especie con rpoB.

Picos caracteristicos de

A bereziniae: 7156, 7407, 7796Da
A. haemolyticus SI 7 A. haemolyticus  
A. johnsonii SI 9 Acinetobacter sp. Diferenciar de A. ursingii y de A. oleovorans mediante rpoB.
A. parvus SI 1 Acinetobacter sp. Colonias muy pequeñas en agar nutritivo. Debido a que no hay experiencia propia, confirmar especie con rpoB.
A Norwegian Forest. schindleri SI 1 A. schindleri  

 

En los casos que dentro del Top Ten la identificación arroja A.baumanii y A. nosocomialis, informar complejo A. baumanii/nosocomialis.

Las siguientes especies no se encuentran representadas en la base de datos del equipo,  por lo que pueden aparecer como Acinetobacter sp., con bajo score y sin lograr el 10% de divergencia entre especies. Para confirmar la identificación en estos casos, se recomienda la secuenciación del gen rpoB:

  • Acinetobacter seifertii
  • Acinetobacter soli
  • Acinetobacter variabilis
  • Acinetobacter beijerinckii
  • Acinetobacter gyllenbergii
  • Acinetobacter venetianus
  • Acinetobacter dijkshoorniae
  • Acinetobacter courvalini
  • Acinetobacter dispersus
  • Acinetobacter modestus
  • Acinetobacter proteolyticus
  • Acinetobacter vivianii

 

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales.

 

Referencias:

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