Florencia Rocca – Página 27

Actinobaculum/ Actinotignum

MALDI-TOF identifica correctamente las especies del género.

Para Actinobaculum schaalii, se aceptan valores de score para una identificación confiable:

SCORE ≥1,7 = identificación a nivel de especie

SCORE 1,5-1,69 = identificación a nivel de género

SCORE <1,5 = no identifica

Para las otras especies (A Core Gothic. urinale, A. suis, A. sanguinis), dados los pocos datos bibiliográficos, informar especie sólo si el score es ≥ 2,0 (sugerido por el fabricante) 카인 아벨.

La especie Actinobaculum massiliense no existe en la taxonomía actual, por lo cual ante un aislado por MALDI-TOF como A. massiliense informar Actinotignum sp 윈도우7 블루투스 드라이버.

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales.

Tabla 6 유튜브 연령 제한 다운로드. Traducción para especies de Actinobaculum/Actinotignum spp.

ID por MALDI-TOF	Presencia en BD	Nro de MSPs en BD	Informar
A 64bit for internet explorer 10. schaalii	SI	3	A. schaalii
A. urinale	SI	1	A 중국어사전. urinale
A. suis	SI	2	A. suis
A 루트킷 다운로드. sanguinis	SI	2	A. sanguinis
A. massiliense	SI	1	Actinotignum sp Free download to cam350.

Referencias:

Lotte R, Lotte L, Ruimy R. Actinotignum schaalii (formerly Actinobaculum schaalii): a newly recognized pathogen-review of the literature Download the framed image. Clin Microbiol Infect 2016;22(1):28-36. doi: 10.1016/j.cmi.2015.10.038.
Schmitt BH, Cunningham SA, Dailey AL, Gustafson DR, Patel R Neat ppt free. Identification of anaerobic bacteria by Bruker Biotyper matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry with on-plate formic acid preparation. J Clin Microbiol 2013;51(3):782-6. doi: 10.1128/JCM.02420-12.
Schulthess B, Bloemberg GV, Zbinden R, Böttger EC, Hombach M. Evaluation of the Bruker MALDI Biotyper for identification of Gram-positive rods: development of a diagnostic algorithm for the clinical laboratory. J Clin Microbiol 2014;52(4): 1089-97. doi: 10.1128/JCM.02399-13.
Yassin AF, Spröer C, Pukall R, Sylvester M, Siering C, Schumann P. Dissection of the genus Actinobaculum: Reclassification of Actinobaculum schaalii Lawson et al. 1997 and Actinobaculum urinale Hall et al. 2003 as Actinotignum schaalii gen. nov., comb. nov. and Actinotignum urinale comb. nov., description of Actinotignum sanguinis sp. nov. and emended descriptions of the genus Actinobaculum and Actinobaculum suis; and re-examination of the culture deposited as Actinobaculum massiliense CCUG 47753T (5DSM 19118T), revealing that it does not represent a strain of this species. Int J Syst Evol Microbiol 2015;65, 615–624. doi: 10.1099/ijs.0.069294-0.

Actinobacillus

Se han aceptado valores de score para una identificación confiable:

SCORE >1,7 = identificación a nivel de especie

SCORE 1,5-1,69 = identificación a nivel de género

SCORE <1,5 = no identifica

Actinobacillus hominis no se encuentra representado en la base de datos del equipo, y puede generarse una inconsistencia al ser identificado como otras especies del género con alto valor de score ni multisim 다운로드.

En todos los casos, se recomienda confirmar la identificación a nivel de especie mediante pruebas fenotípicas adicionales (Ver Tabla 5).

Tabla 4 Download music without copyright. Traducción para especies de Actinobacillus spp.

ID por MALDI-TOF	Presencia en BD	Nro de MSPs en BD	Informar	Observaciones
A Download the protocol. lignieresii	SI	1	Actinobacillus lignieresii/ pleuropneumoniae
A Download Millennium Gymnastics. pleuropneumoniae	SI	2	Actinobacillus lignieresii/ pleuropneumoniae
A Download the Real Steel bugplate. ureae	SI	1	A. ureae	Informar con valor de score ≥ 2,0
A gx simulator. suis	SI	1	Actinobacillus suis/ equuli
A. equuli	SI	1	Actinobacillus suis/ equuli
A 절전모드. hominis	NO

Tabla 5 Download Messenger by Hanbi. Características fenotípicas de especies de Actinobacillus spp.

Ensayo	Actinobacillus lignieresii	Actinobacillus pleuropneumoniae	Actinobacillus equuli	Actinobacillus suis	Actinobacillus ureae	Actinobacillus hominis	Aggregatibacter actinomycetemcomitans
Hemólisis	–	+	V	+	–	–	–
Hidrólisis de Esculina	–	–	–	+	–	V	–
Ureasa	+	+	+	+	+	+	–
ONPG	+	+	+	V	–	+
Acido de Lactosa	V	V	+	+	–	+	–
Acido de Trehalosa	–	–	+	+	–	+	–
Acido de Melibiosa	–	–	+	+	–	+	–

Símbolos: V, variable Buddhist meditation music.

Referencias:

Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11^th edition jquery poi excel. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
Montagnania C, Pecile P, Moriondo M, Petricci P, Becciani S, Chiappini E, Indolfi G, Rossolini GM, Azzari C, de Martino M, Galli L. First Human Case of Meningitis and Sepsis in a Child Caused by Actinobacillus suis or Actinobacillus equuli. J Clin Microbiol 2015;53(6):1990-2. doi: 10.1128/JCM.00339-15.

Schulthess B, Bloemberg GV, Zbinden A, Mouttet F, Zbinden R, Böttger EC, Hombach M. Evaluation of the Bruker MALDI Biotyper for Identification of Fastidious Gram-Negative Rods. J Clin Microbiol 2016;54(3): 543–548. doi: 10.1128/JCM.03107-15.

Acinetobacter

Las limitaciones de MALDI-TOF ocurren en la identificación de las especies del complejo A. calcoaceticus/A. baumannii, A. junii/A. johnsonii y A. guillouiae, y para aquellas especies que están pobremente representadas o no están incluidas en la base de datos de espectros proteicos, como A. soli, A. beijerinckii, A. berenziniae, A. variabilis.

Para una completa identificación a nivel de especie se requiere la secuenciación de genes tales como rpoB, gyrB y recA.

Los resultados serán informados siguiendo las recomendaciones del fabricante y considerando el criterio del 10% de divergencia entre la primera especie y la distinta siguiente del Top Ten.

SCORE ≥2,0 = identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

Tabla 3 맥 에버노트 다운로드. Traducción para especies de Acinetobacter spp.

ID por MALDI-TOF	Presencia en BD	Nro de MSPs en BD	Informar solo con score ≥ 2	Observaciones
A. pitti	SI	18	A. pitti
A. nosocomialis	SI	8	Acinetobacter sp.	A. baumannii puede ser identificado como A. nosocomialis. Informar complejo A. baumanii/nosocomialis Confirmar especie mediante rpoB.
A. baumannii	SI	12	A. baumannii	A 블리자드 디아블로2 확장팩 다운로드. baumannii puede ser identificado como A. nosocomialis. Informar complejo A. baumanii/nosocomialis
A. calcoaceticus	SI	10	Complejo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii
A. guillouiae	SI	2	Acinetobacter sp.	Confirmar especie con rpoB. Picos caracteristicos de A. guillouiae: 3258, 3690, 6513, 6978, 7378, 7813Da.
A. junii	SI	8	A. junii/A johnsonii
A 오토캐드 2018 한글. radioresistens	SI	8	A. radioresistens
A. baylyi	SI	3	Acinetobacter sp.	Diferenciar de A. bereziniae y de A.soli. Confirmar especie con rpoB
A. ursingii	SI	9	A. ursingii
A. lwoffii	SI	11	A. lwoffii
A. bereziniae	SI	1	Acinetobacter sp gpg4win 다운로드.	Confirmar especie con rpoB. Picos caracteristicos de A bereziniae: 7156, 7407, 7796Da
A. haemolyticus	SI	7	A. haemolyticus
A. johnsonii	SI	9	Acinetobacter sp.	Diferenciar de A. ursingii y de A. oleovorans mediante rpoB.
A. parvus	SI	1	Acinetobacter sp.	Colonias muy pequeñas en agar nutritivo. Debido a que no hay experiencia propia, confirmar especie con rpoB.
A Norwegian Forest. schindleri	SI	1	A. schindleri

En los casos que dentro del Top Ten la identificación arroja A.baumanii y A. nosocomialis, informar complejo A. baumanii/nosocomialis.

Las siguientes especies no se encuentran representadas en la base de datos del equipo, por lo que pueden aparecer como Acinetobacter sp., con bajo score y sin lograr el 10% de divergencia entre especies. Para confirmar la identificación en estos casos, se recomienda la secuenciación del gen rpoB:

Acinetobacter seifertii
Acinetobacter soli
Acinetobacter variabilis
Acinetobacter beijerinckii
Acinetobacter gyllenbergii
Acinetobacter venetianus
Acinetobacter dijkshoorniae
Acinetobacter courvalini
Acinetobacter dispersus
Acinetobacter modestus
Acinetobacter proteolyticus
Acinetobacter vivianii

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales.

Referencias:

Bouvet PJM, Grimont PAD. Taxonomy of the Genus Acinetobacter with the Recognition of Acinetobacter baumannii sp. nov., Acinetobacter haemolyticus sp. nov., Acinetobacter johnsonii sp. nov., and Acinetobacter junii sp. nov. and Emended Descriptions of Acinetobacter calcoaceticus and Acinetobacter lwoffii sonar. Int J Syst Bacteriol 1986; 36, 228-240. doi: 10.1099/00207713-36-2-228
Cosgaya C, Marí-Almirall M, Van Assche A, Fernández-Orth D, Mosqueda N, Telli M, Huys G, Higgins PG, Seifert H, Lievens B, Roca I, Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int J Syst Evol Microbiol 2016;66(10): 4105-4111. doi: 10.1099/ijsem.0.001318.

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Hsueh P, Kuo L, Chang T, Lee T, Teng S, Chuang Y, Teng L, Sheng W. Evaluation of the Bruker Biotyper Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry System for Identification of Blood Isolates of Acinetobacter Species Man in the Dark. J Clin Microbiol 2014;52(8): 3095–3100. doi: 10.1128/JCM.01233-14

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Kishii K, Kikuchi K, Matsuda N, Yoshida A, Okuzumi K, Uetera Y, Yasuhara H, Moriya K. Evaluation of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry for species identification of Acinetobacter strains isolated from blood cultures. Clin Microbiol Infect 2014;20(5):424-30. doi: 10.1111/1469-0691.12376.
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Nemec A, De Baere T, Tjernberg I, Vaneechoutte M, van der Reijden TJ, Dijkshoorn L. Acinetobacter ursingii sp. nov. and Acinetobacter schindleri sp. nov., isolated from human clinical specimens. Int J Syst Evol Microbiol 2001; 51 (5): 1891-1899. doi: 10.1099/00207713-51-5-1891.
Nemec A, Krizova L, Maixnerova M, Sedo O, Brisse S, Higgins PG. Acinetobacter seifertii sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus–Acinetobacter baumannii complex isolated from human clinical specimens. Int J Syst Evol Microbiol 2015;65, 934-942. doi: 10.1099/ijs.0.000043.

Nemec A, Dijkshoorn L, Cleenwerck I, De Baere T, Janssens D, Van Der Reijden TJ, Jezek P, Vaneechoutte M. Acinetobacter parvus sp. nov., a small-colony-forming species isolated from human clinical specimens. Int J Syst Evol Microbiol 2003;53(5):1563-1567 cisco tftp 다운로드. doi: 10.1099/ijs.0.02631-0.
Nemec A, Krizova L, Maixnerova M, van der Reijden TJ, Deschaght P, Passet V, Vaneechoutte M, Brisse S, Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus– Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13TU). Res Microbiol 2011; 162(4): 393-404. doi: 10.1016/j.resmic.2011.02.006.
Nemec A, Musílek M, Maixnerová M, De Baere T, van der Reijden TJ, Vaneechoutte M, Dijkshoorn L. Acinetobacter beijerinckii sp. nov. and Acinetobacter gyllenbergii sp. nov., haemolytic organisms isolated from humans. Int J Syst Evol Microbiol 2009;59 (1): 118-124 Respond 1988 4. doi: 10.1099/ijs.0.001230-0.
Nemec A, Musílek M, Sedo O, De Baere T, Maixnerová M, van der Reijden TJ, Zdráhal Z, Vaneechoutte M, Dijkshoorn L. Acinetobacter bereziniae sp. nov. and Acinetobacter guillouiae sp. nov., to accommodate Acinetobacter genomic species 10 and 11, respectively. Int J Syst Evol Microbiol 2010;60(4): 896-903. doi: 10.1099/ijs.0.013656-0.
Nemec A, Radolfova-Krizova L, Maixnerova M, Vrestiakova E, Jezek P, Sedo O.Taxonomy of haemolytic and/or proteolytic strains of the genus Acinetobacter with the proposal of Acinetobacter courvalinii sp. nov. (genomic species 14 sensu Bouvet & Jeanjean), Acinetobacter dispersus sp. nov. (genomic species 17), Acinetobacter modestus sp. nov., Acinetobacter proteolyticus sp. nov. and Acinetobacter vivianii sp. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2016;66(4): 1673-85. doi: 10.1099/ijsem.0.000932.

Nishimura Y, Ino T, Iizuka H. Acinetobacter radioresistens sp. nov. Isolated from Cotton and Soil. Int J Syst Bacteriol 1988; 38, 209-211. doi: 10.1099/00207713-38-2-209.

Acidovorax

El género Acidovorax comprende, en su gran mayoría, especies ambientales o patogénicas de plantas. Solamente A. delafieldii, A Download the wild dogs. temperans, A facillis, A. avenae, A. oryzae, y A. wautersii han sido aisladas a partir de muestras clínicas.

Existe poca evidencia científica para evaluar la fiabilidad de Acidovorax 온새미로. Dada su rareza en aislamientos clínicos, y debido a la limitada experiencia con aislamientos propios, se sugiere informar sólo a nivel de género según los criterios recomendados por el fabricante Download the national anthem.

Es decir, a partir de score >1,7 se informa Acidovorax sp.

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas computer music.

Tabla 2. Traducción para especies de Acidovorax spp. aisladas de muestras clínicas.

Especie	Presencia en Base de datos Bruker (BD)	Nro de MSPs en BD
delafieldii	SI	1
temperans	SI	2
facillis	SI	2
avenae	SI	2
oryzae	NO
wautersii	NO

Referencias:

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Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11^th edition 문자 벨소리. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.

Malkan AD, Strollo W, Scholand SJ, Dudrick SJ. Implanted-port-catheter-related sepsis caused by Acidovorax avenae and methicillin-sensitive Staphylococcus aureus 윈도우10 pro k iso. J Clin Microbiol 2009;47(10): 3358–3361. doi: 10.1128/JCM.01093-09.
Orsborne C, Hardy A, Isalska B, Williams SG, Muldoon EG 킹오파 97. Acidovorax oryzae Catheter-Associated Bloodstream Infection. J Clin Microbiol 2014; 52(12): 4421–4424 유니캐드. doi:10.1128/JCM.00657-14.

Vaneechoutte M, Janssens M, Avesani V, Delmée M, Deschaght P. Description of Acidovorax wautersii sp. nov. to accommodate clinical isolates and an environmental isolate, most closely related to Acidovorax avenae. Int J Syst Evol Microbiol 2013;63(6):2203-6. doi: 10.1099/ijs.0.046102-0.

Wang Y, Zhou Q, Li B, Liu B, Wu G, Ibrahim M, Xie G, Li H, Sun G. Differentiation in MALDI-TOF MS and FTIR spectra between two closely related species Acidovorax oryzae and Acidovorax citrulli. BMC Microbiol 2012;12:182. doi: 10.1186/1471-2180-12-182.

Achromobacter

La taxonomía del género Achromobacter está íntimamemente asociada al género Alcaligenes.

La mayoría de las especies del género pueden ser diferenciadas usando la secuenciación parcial del gen nrdA. Como alternativa se puede realizar la técnica de MLST en base a los genes atpD, icd, recA, rpoB y gyrB.

La secuenciación parcial del 16S ARNr no discrimina las especies del género 두번사는 랭커.

IMPORTANTE: cualquiera de las especies identificadas por MALDI-TOF, se recomienda que sean informadas como Achromobacter sp., puesto que no se logra identificación a nivel de especie.

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas.

Tabla 1. Traducción de especies de Achromobacter de origen clínico Download the spring jsp file.

Especie	Presencia en Base de datos Bruker (BD)	Nro de MSPs en BD
A. xylosoxidans	SI	7
A. ruhlandii	SI	1
A Download the virus total sample. marplatensis	NO
A. pulmonis	NO
A. dolens	NO
A. insuavis	NO
A 맨발 의 꿈 다운로드. denitrificans	SI	3
A. mucicolens	NO
A. animicus	NO
A. aegrifaciens	NO
A 포장마차 mp3. anxifer	NO
A. insolitus	SI	2
A. piechaudii	SI	2
A. sediminum	NO
A Zhang Sase downloaded The Tekbon. spanius	SI	2
A.spiritinus	NO

Referencias:

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Rodrigues ER, Ferreira AG, Leão RS, Leite CC, Carvalho-Assef AP, Albano RM, Marques EA. Characterization of Achromobacter Species in Cystic Fibrosis Patients: Comparison of bla(OXA-114) PCR Amplification, Multilocus Sequence Typing, and Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry Simplified. J Clin Microbiol 2015;53(12):3894-6. doi: 10.1128/JCM.02197-15
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