Autor: Florencia Rocca

Bacteroides

Se recomiendan los criterios aceptados en la bibliografía:

SCORE ≥1,8 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,6-1,79 = identificación a nivel de género

SCORE <1,6 = no identifica

 

Según Jorgensen et al. (2015) la  identificación a nivel de especie es correcta.

Sin embargo sugerimos discriminar la identificación en ciertos casos:

Cuando MALDI-TOF arroje un resultado de Bacteroides ovatus, se deberá informar Bacteriodes ovatus/ xylanisolvens debido a su estrecha similitud y a la ausencia de este último en la base de datos del equipo, o realizar pruebas manuales útiles en su diferenciación (Ver Tabla 18).

Por otra parte, MALDI-TOF puede dar como Bacteroides stercoris, las especies Bacteroides fragilis/clarus (Ver Tabla 18 a continuación) Download zbrush 2019.

 

Tabla 18. Diferenciación fenotípica de especies de Bacteroides spp. con dificultades por MALDI-TOF.

 

Especie

 

 Indol Catalasa α-Fucosidasa Arabinosa Trehalosa Xilosa
B. stercoris + V V – – +
B. fragilis – + + – – +
B Download ps4 standby game. clarus + – – – W +
B. ovatus + + + + + +
B. xylanisolvens – – + + + +

Símbolos: V, variable; W, débil cs5 일러스트 다운로드.

 

Tabla 19. Traducción para especies del género Bacteroides spp.

Especie Presencia en  BD Nro de MSPs en BD
B. caccae SI 5
B. stercoris SI 5
B. cellulosilyticus SI 3
B. clarus SI 1
B 위임장 양식. fluxus SI 1
B. coagulans SI 1
B. coprocola SI 1
B. coprophilis SI 1
B. dorei NO  
B. eggerthii SI 3
B download oscdimg exe. faecis SI 2
B. finegoldii SI 3
B. pectinophilus NO  
B. galacturonicus NO  
B. intestinalis SI 4
B. massiliensis SI 6
B cass photos. nordii SI 6
B. salyersae SI 9
B. oleiciplenus SI 1
B. ovatus SI 6
B. fragilis SI 14
B. plebeius SI 1
B Eighteen Moments 1.. thetaiotaomicron SI 8
B. uniformis SI 10
B. vulgatus SI 8
B. xylanisolvens NO  
B. pyogenes SI 7

 

Referencias:

  • Johnson JL, Moore WEC, Moore LVH Skype apk. Bacteroides caccae sp. nov., Bacteroides merdae sp. nov., and Bacteroides stercoris sp. nov. isolated from human feces. Int J Syst Bacteriol 1986;36, 499-501. doi: 10.1099/00207713-36-4-499.
  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • Rodríguez-Sánchez B, Alcalá L, Marín M, Ruiz A, Alonso E, Bouza E 팀포트리스. Evaluation of MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization Time-of- Flight Mass Spectrometry) for routine identification of anaerobic bacteria. Anaerobe 2016;42:101-107. doi: 10.1016/j.anaerobe.2016.09.009.
  • Watanabe Y, Nagai F, Morotomi M, Sakon H, Tanaka R. Bacteroides clarus sp. nov., Bacteroides fluxus sp. nov. and Bacteroides oleiciplenus sp. nov., isolated from human faeces. Int J Syst Evol Microbiol 2010;60(8):1864-1869 키즈왕국.  doi: 10.1099/ijs.0.015107-0.

 

Bacillus

Se emplean los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

 

Aclaración: puede dar fallas en la identificación según el grado de esporulación; utilizar cultivos frescos.

 

Informar como Bacillus grupo cereus (incluye las especies B. cereus, B.  thuringiensis, B. mycoides, B. pseudomycoides, B. cytotoxicus, B. weihenstephanensis y B. toyonensis).

Bacillus anthracis (grupo Bacillus cereus) no forma parte de la base de datos por ser un agente de bioterrorismo 5월 25일 웹하드. Por lo tanto, ante un aislamiento Lecitinasa positiva, gamma hemolítico e inmóvil, confirmar la sospecha de Bacillus anthracis mediante biología molecular.

 

Se recomienda completar la identificación de las especies del grupo Bacillus cereus mediante el perfil de pruebas bioquímicas (Ver Anexo).

También se puede realizar secuenciación del gen 16S ARNr, y de no lograrse discriminación completar con otros genes: 23S ARNr,  gyrB, rpoB y groEL; del  mismo modo que ocurre con el resto de los grupos del género visio 2010 다운로드.

 

Tabla 17. Traducción para las especies del género Bacillus spp.

ID por MALDI-TOF Presencia en  BD Nro de MSPs en BD  

Informar

  

Comentarios
B. cereus SI 3 Bacillus grupo cereus  
B. thuringiensis SI 1 Bacillus grupo cereus  
B microsoft toolkit 2.5 3. mycoides SI 1 Bacillus grupo cereus  
B. pseudomycoides SI 1 Bacillus grupo cereus  
B. weihenstephanensis SI 1 Bacillus grupo cereus  
B 맥북 매버릭스 다운로드. subtilis SI 9 Bacillus grupo subtilis  
B. atrophaeus SI 4 Bacillus grupo subtilis  
B. mojavensis SI 1 Bacillus grupo subtilis  
B 가상시디롬 다운로드. vallismortis SI 1 Bacillus grupo subtilis  
B. sonorensis SI 1 Bacillus grupo subtilis  
B. amyloliquefaciens SI 1 Bacillus grupo subtilis  
B asus 드라이버 다운로드. licheniformis SI 3 B. licheniformis Informar a nivel de especie si da anaerobiosis +
B. pumilus SI 6 Bacillus grupo pumilus  
B. safensis SI 1 Bacillus grupo pumilus  
B Download oriental paintings. altitudinis SI 2 Bacillus grupo pumilus  
B. megaterium SI 3 B. megaterium  
B. circulans SI 2 Bacillus grupo circulans  
B 헝거게임. firmus SI 1 Bacillus grupo circulans  
B. lentus SI 2 Bacillus grupo circulans  
B. coagulans SI 2 Bacillus grupo circulans  
B Download old friends. clausii SI

 

 3 B. clausii Confirmar con 16S ARNr o gyrB
B. halmapalus SI 1 Bacillus sp. Confirmar con  gyrB
B. horikoshii SI 1 Bacillus sp. Confirmar con gyrB

 

 

 

 

 

Las siguientes especies no se encuentran representadas en la base de datos del equipo:

  • B 지니 모션. toyonensis  (grupo B. cereus)
  • B. cytotoxicus (grupo B. cereus)
  • Bacillus beringensis / kortensis
  • Bacillus borboni / carboniphilus
  • Bacillus stratosphaericus / B. aerophilus (grupo B. pumilus)
  • B. velezensis (grupo B. subtilis)
  • B. rhizosphareae

Las mismas han sido confirmadas mediante biología molecular.

 

Referencias:

  • Bavykin SG, Lysov YP, Zakhariev V, Kelly JJ, Jackman J, Stahl DA, Cherni A. Use of 16S rRNA, 23S rRNA, and gyrB gene sequence analysis to determine phylogenetic relationships of Bacillus cereus group microorganisms. J Clin Microbiol 2004;42(8):3711-30. doi: 10.1128/JCM.42.8.3711-3730.2004.
  • Rooney AP, Price NP, Ehrhardt C, Swezey JL, Bannan JD. Phylogeny and molecular taxonomy of the Bacillus subtilis species complex and description of Bacillus subtilis subsp. inaquosorum subsp. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2009;59(10):2429-36. doi: 10.1099/ijs.0.009126-0.
  • Senesi S, Celandroni F, Tavanti A, Ghelardi E. Molecular Characterization and Identification of Bacillus clausii Strains Marketed for Use in Oral Bacteriotherapy. Appl Environ Microbiol 2001;67(2): 834–839. doi: 10.1128/AEM.67.2.834-839.2001.

 

Autor Publicado el Categorías Bacillus

Arthrobacter

Debido a limitada experiencia, se recomienda informar sólo género: Arthrobacter sp. con valor de score ≥1,5.

Es necesaria la secuenciación parcial del gen 16S ARNr para una completa identificación Thank you for downloading the family song.

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales.

Tabla 16. Traducción de especies de  Arthrobacter  spp 쌉니다 천리마마트 5화.

Especie Presencia en  BD Nro de MSPs en BD
A 보이스 다운로드. oxydans SI 2
A. scleromae SI 2
A sql server 2016 developer 다운로드. cumminsii SI 5
A. albus NO  
A Download the subtitle font. luteolus SI 1
A. creatinolyticus SI 3
A 씽씽펜. woluwensis SI 1
A. citreus SI 2

 

Referencias:

  • Funke G, Hutson RA, Bernard KA, Pfyffer GE, Wauters G, Collins MD 아프리카티비 동영상. Isolation of Arthrobacter spp. from clinical specimens and description of Arthrobacter cumminsii sp. nov. and Arthrobacter woluwensis sp download keysharpnxbiz.exe. nov. J Clin Microbiol 1996;34(10):2356-2363.
  • Hou XG, Kawamura Y, Sultana F, Shu S, Hirose K, Goto K, Ezaki T. Description of Arthrobacter creatinolyticus sp.nov., isolated from human urine Download Netmarble Poker. Int J Syst Bacteriol 1998;48,423-429. doi: 10.1099/00207713-48-2-423.
  • Huang Y, Zhao N, He L, Wang L, Liu Z, You M, Guan F. Arthrobacter scleromae sp 이클립스 sts 플러그인. nov. isolated from human clinical specimens. J Clin Microbiol 2005;43(3):1451-1455. doi: 10.1128/JCM.43.3.1451-1455.2005.
  • Koch C, Rainey FA, Stackebrandt E. 16S rDNA studies on members of Arthrobacter and Micrococcus: An aid for their future taxonomic restructing. FEMS Microbiol Lett 1994;123(1-2)167-171. doi: https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1994.tb07217.x.
  • Vargha M, Takáts Z, Konopka A, Nakatsu CH. Optimization of MALDI-TOF MS for strain level differentiation of Arthrobacter isolates. J Microbiol Methods 2006;66(3):399-409. doi: 10.1016/j.mimet.2006.01.006.
  • Wauters G, Charlier J, Janssens M, Delmée M. Identification of Arthrobacter oxydans, Arthrobacter luteolus sp. nov., and Arthrobacter albus sp. nov., isolated from human clinical specimens. J Clin Microbiol 2000;38(6): 2412-15.

 

Arcobacter

La identificación se realiza según recomendaciones del fabricante. No existe validación molecular en nuestra experiencia.

SCORE ≥2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

 

Tabla 15 Download Tabula. Traducción de especies de Arcobacter  sp. más frecuentemente halladas en muestras clínicas.

Especie Presencia en BD Nro de MSPs en BD
A 중국어 배우기. butzleri SI 4
A. cibarius SI 1
A Download Rambo4. cryaerophilus SI 6
A. mytili NO  
A Download the drama for free. nitrofigilis SI 1
A. skirrowii SI 2
A Download Vickers. thereius NO  

Se recomienda consultar el Anexo para la identificación microbiológica mediante pruebas fenotípicas adicionales Download the Jumong series.

 

Referencias:

  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition nx7.5 다운로드. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • SITIO WEB: LPS bacterio.net

Arcanobacterium

Arcanobacterium haemolyticum: informar a nivel de especie con valor de score ≥1,7. Existen 6 MSPs en la base de datos correspondientes a este microorganismo 스케치업 2016 32비트 크랙.

 

Pruebas adicionales sugeridas:

Catalasa (-), Esculina (-), Ureasa (-), Gelatinasa (-)

Hemólisis (+), pyrazinamidasa (+), DNAsa (+), CAMP reverso (+)

 

Referencias:

  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW I downloaded it. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • Miyamoto H, Suzuki T, Murakami S, Fukuoka M, Tanaka Y, Kondo T, Nishimiya T, Suemori K, Tauchi H, Osawa H 구글 캘린더 가젯 다운로드. Bacteriological characteristics of Arcanobacterium haemolyticum isolated from seven patients with skin and soft-tissue infections. J Med Microbiol 2015;64, 369–374 Download the Japanese keyboard. doi: 10.1099/jmm.0.000038.