Autor: Florencia Rocca

Brevibacillus

Se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥ 2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE < 1,7 = no identifica

 

Tabla 23 ban changko movie. Traducción para especies de Brevibacillus spp. aisladas de muestras clínicas.

Especie Presencia en BD Nro de MSPs en BD
B 비정상회담 1 회 다운로드. brevis SI 2
B. borstelensis SI 2
B Download Inosu. laterosporus SI 2
B. parabrevis SI 2
B Download The Inven 2019. agri SI 1
B. centrosporus SI 1
B 윈도우7 크롬. massiliensis NO  
B. invocatus SI 1

 

Referencias:

  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW Download the movie in the age of loss. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • SITIO WEB: www.bacterio.net

Bordetella

Se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥ 2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE < 1,7 = no identifica

 

  1. bronchiseptica, B. pertussis y B. parapertussis no son correctamente diferenciadas por Espectrometría de masas aplicando los criterios del fabricante.

Se recomienda utilizar los siguientes criterios:

  1. Score ≥2 + Categoría de Consistencia A = identificación a nivel de especie
  2. Score ≥2 + Categoría de Consistencia B = aplicar divergencia del 5% para informar la especie, de lo contrario informar sólo el género rufus 2.8 다운로드.
  • Score 1,7-1,9 y top ten con una sola especie = identificación a nivel de especie
  1. Score 1,7-1,9 y top ten con distintas especies= aplicar divergencia del 5% para informar la especie, de lo contrario informar sólo el género.

 

Consistencia A: la primera especie identificada aparece en color verde, el resto de los pocillos en color verde corresponden a esa misma especie. Si aparecen resultados en amarillo corresponden al menos al mismo género que la primera.

 

Consistencia B: la primera especie identificada aparece en verde o amarillo; otras especies del género  pueden aparecer en verde o amarillo 소장 양식. No se cumple el criterio de identificación al nivel de especie.

 

Tabla 21. Traducción para especies de Bordetella spp. aisladas de muestras clínicas.

Especie Presencia en BD Nro de MSPs en BD
B. avium SI 2
B. bronchialis NO  
B 트위터 방송. bronchiseptica SI 9
B. flavilis NO  
B. hinzii SI 5
B. homesii SI 3
B. parapertussis SI 11
B. pertussis SI 10
B blackjack. petrii SI 7
B. sputigena NO  
B. trematum SI 4

 

Tabla 22. Pruebas fenotípicas de las especies de Bordetella spp.

 

 

Ensayo

 B. pertussis B 마인크래프트 전쟁맵 다운로드. parapertussis B. bronchiseptica B. avium B. hinzii B. holmesii B. petrii B. trematum B. bronchialis B. flabilis B. sputigena
Oxidasa + – + + + – + – + + +
Catalasa + + + + – + + + + + +
Movilidad – – + – + – – + + + +
Pigmento – marrón – – – marrón amarillo – – – –
Desarrollo en Mac Conkey nd + + + + + + + + + +
Urea – + + – – – – – nd nd nd

Símbolos: w, débil; nd, no determinado Download the text notification.

Algoritmo  de PCR propuesto por el LNR (Servicio Bacteriología Clínica) para la identificación y la confirmación de las especies de Bordetella relacionadas a Coqueluche:

 

  • B. pertussis:

Blancos de amplificación utilizados: IS481 + ptxS1 ó IS481 + ptxP

 

  • B. parapertussis:

Blancos de amplificación utilizados: pIS1001 + ptxS1

 

Blancos de amplificación utilizados: IS481 + hIS1001

 

Para la confirmación de estas especies es necesario utilizar al menos dos blancos de amplificación distintos.

 

 

Referencias:

  • Gentry-Weeks, Hultsch AL, Kelly SM, Keith JM, Curtiss R. Cloning and sequencing of a gene encoding a 21-kilodalton outer membrane protein from Bordetella avium and expression of the gene in Salmonella typhimurium. J Bacteriol 1992;174 (23): 7729-42.
  • Glare EM, Paton JC, Premier RR, Lawrence AJ, Nisbet IT. Analysis of a repetitive DNA sequence from Bordetella pertussis and its application to the diagnosis of pertussis using the polymerase chain reaction. J Clin Microbiol 1990;28(9):1982–1987 movavi video converter 다운로드.
  • Grimprel E, Bégué P, Anjak I, Betsou F, Guiso N. Comparison of polymerase chain reaction, culture, and Western immunoblot serology for diagnosis of Bordetella pertussis infection. J Clin Microbiol 1993;31(10):2745–2750.
  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • Lind-Brandberg L, Welinder-Olsson C, Lagergård T, Taranger J, Trollfors B, Zackrisson G Download paid fonts. Evaluation of PCR for diagnosis of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis infections. J Clin Microbiol 1998;36(3):679–83.
  • Njamkepo E, Bonacorsi S, Debruyne M, Gibaud SA, Guillot S, Guiso N. Significant Finding of Bordetella holmesii DNA in Nasopharyngeal Samples from French Patients with Suspected Pertussis. J Clin Microbiol 2011; 49(12):4347–4348. doi:  10.1128/JCM.01272-11.
  • SITIO WEB: www.uniprot.org
  • Tatti KM, Sparks KN, Boney KO, Tondella ML. Novel multitarget
    real-time PCR assay for rapid detection of Bordetella species in
    clinical specimens rpg게임 다운로드. J Clin Microbiol 2011;49(12):4059–4066. doi: 10.1128/JCM.00601-11.
  • Tatti KM, Wu KH, Tondella ML, Cassiday PK, Cortese MM, Wilkins PP, Sanden GN. Development and evaluation of dual-target real-time polymerase chain reaction assays to detect Bordetella spp. Diagn Microbiol
    Infect Dis 2008;61(3):264–272. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2008.02.017.
  • van der Zee A, Agterberg C, van Agterveld M, Peeters M, Mooi FR. Characterization of IS1001, an insertion sequence element of Bordetella parapertussis. J Bacteriol 1993;175(1):141–147. doi:10.1128/jb.175.1.141-147.1993.
  • Zintgraff J, Irazu L, Lara CS, Rodriguez M, Santos M. The classical Bordetella species and MALDI-TOF technology: a brief experience. J Med Microbiol 2018;67(12):1737-1742. doi: 10.1099/jmm.0.000860.

Bifidobacterium

Se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥ 2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE < 1,7 = no identifica

Según datos de escasa experiencia de aislados secuenciados, Bifidobacterium scardovii puede ser informada a nivel de especie con valores de score  ≥ 1,7 인간극장 bgm.

 

Tabla 20. Traducción para especies del género Bifidobacterium spp.

Especie Presencia en BD Nro de MSPs en BD
B 안전보건표지. adolescentis

(incluye B. angulatum y B. merycicum)

 SI 4
B 원더우먼 자막. breve SI 5
B. dentium SI 4
B 슈츠 시즌7. infantis NO  
B. longum SI 6
B 윈도우7 32비트. scardovii SI 3
B. suis NO  
B Yuyube. asteroides SI 2
B. bifidum SI 5
B 낭만닥터 김사부2 다운로드. catenulatum SI 2
B. magnum SI 2
B Shanghai Mahjong. pseudocatenulatum SI 2
B. animalis SI 3

 

 Referencias:

  • Barberis C, Almuzara M, Join-Lambert O, Ramırez MS, Famiglietti A, Vay C 파이어폭스 유튜브 동영상. Comparison of the Bruker MALDI-TOF mass spectrometry system and conventional phenotypic methods for identification of Gram-positive rods. PLoS One 2014;9(9):e106303 학교괴담. doi: 10.1371/journal.pone.0106303.
  • Jorgensen JH, Pfaller MA, Carroll KC, Funke G, Landry ML, Richter SS, Warnock DW. Manual of Clinical Microbiology, 11th edition. ASM Press, Washington, DC, 2015. doi: 10.1128/9781555817381.
  • Junick J, Blaut M. Quantification of human fecal Bifidobacterium species by use of quantitative real-time PCR analysis targeting the groEL gene. Appl Environ Microbiol 2012;78(8):2613-22. doi: 10.1128/AEM.07749-11.
  • Schulthess B, Bloemberg GV, Zbinden R, Böttger EC, Hombach M. Evaluation of the Bruker MALDI Biotyper for identification of Gram-positive rods: development of a diagnostic algorithm for the clinical laboratory. J Clin Microbiol 2014;52(4): 1089-97. doi: 10.1128/JCM.02399-13.
  • Shafer D, Liu H, Dong J, Liu W, Loft J, Phelps T, Zhang Y. Comparison of direct smear and chemical extraction methods for MALDI-TOF mass spectrometry identification of clinical relevant anaerobic bacteria. Front Lab Med 2017;1(1):27-30. https://doi.org/10.1016/j.flm.2017.02.011.
  • Švec P, Šedo O, Teshim A, Dráb V, Zdráhal Z, Sedláček I. Identification of Bifidobacterium spp. isolated from children intestinal mucous tissue samples by MALDI-TOF MS and automated ribotyping. 4th Congress of European Microbiologists FEMS 2011.
  • Turroni F, Duranti S, Bottacini F, Guglielmetti S, Van Sinderen D, Ventura M. Bifidobacterium bifidum as an example of a specialized human gut commensal. Front Microbiol 2014;5:437. doi:  10.3389/fmicb.2014.00437

 

Bergeyella

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Existe un solo espectro de referencia en MALDI-TOF que corresponde a Bergeyella zoohelcum.

Se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

SCORE ≥2,0 =  identificación a nivel de especie                         

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

 

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Bartonella

Las especies del género Bartonella son consideradas patógenos emergentes; poseen un ciclo natural que incluye infección persistente intraeritrocitaria en un huésped que actúa como reservorio Dick Funks. Los vectores artrópodos transmiten la bacteria entre el reservorio y un huésped susceptible, incluyendo humanos.

De las 19 especies reconocidas oficialmente, las más comunes como patógenos humanos son: Bartonella bacilliformis, Bartonella quintana y Bartonella henselae 퍼즐버블버블.

Las especies de Bartonella crecen muy lentamente, requiriendo desde 7 días hasta 6 semanas de incubación.

Suelen ser identificadas mediante técnicas moleculares (genes diana: 16S ARNr, gltA, rpoB, ribC, ftsZ, groEL) 오피스 2007 sp3.

 

De acuerdo a la bibliografía, MALDI-TOF identifica correctamente las especies del género luego de incorporar a la base de datos comercial, perfiles proteicos (MSP) de cepas de referencia download rjava.

Existe un único espectro de referencia en la base de datos del equipo y corresponde a Bartonella japonica.

 

Debido a escasa experiencia se recomienda aplicar los criterios recomendados por el fabricante:

 

SCORE ≥2,0 =  identificación a nivel de especie

SCORE 1,7-1,99 = identificación a nivel de género

SCORE <1,7 = no identifica

 

Referencias:

  • Fournier PE, Couderc C, Buffet S, Flaudrops C, Raoult D Download Hangul and Computer 2010. Rapid and cost-effective identification of Bartonella species using mass spectrometry. J Med Microbiol 2009;58(9):1154-9. doi: 10.1099/jmm.0.009647-0 알송 모바일.
  • SITIO WEB: http://www.bacterio.cict.fr/b/bartonella.html